中華民國八十九年五月二十日總統令:
特任游錫堃為行政院副院長。
特任林能白為行政院政務委員兼行政院公共工程委員會主任委員。
特任黃榮村、陳錦煌、張有惠、胡錦標、蔡清彥為行政院政務委員。
特任張博雅為內政部部長並為行政院政務委員兼臺灣省政府委員兼主席。
特任田弘茂為外交部部長,伍世文為國防部部長,許嘉棟為財政部部長,曾志朗為教育部部長,陳定南為法務部部長,林信義為經濟部部長,葉菊蘭為交通部部長,徐正光為蒙藏委員會委員長,張富美為僑務委員會委員長,並均為行政院政務委員。
特任魏啟林為行政院秘書長。
特任林全為行政院主計處主計長,朱武獻為行政院人事行政局局長,李明亮為行政院衛生署署長,林俊義為行政院環境保護署署長,王郡為行政院海岸巡防署署長,杜正勝為國立故宮博物院院長,蔡英文為行政院大陸委員會主任委員,陳博志為行政院經濟建設委員會主任委員,楊德智為行政院國軍退除役官兵輔導委員會主任委員,林芳玫為行政院青年輔導委員會主任委員,夏德鈺為行政院原子能委員會主任委員,翁政義為行政院國家科學委員會主任委員,林嘉誠為行政院研究發展考核委員會主任委員,陳希煌為行政院農業委員會主任委員,陳郁秀為行政院文化建設委員會主任委員,陳菊為行政院勞工委員會主任委員,尤哈尼‧伊斯卡卡夫特為行政院原住民委員會主任委員,許義雄為行政院體育委員會主任委員。
特任顏忠誠為福建省政府委員兼主席。
任命鍾琴為行政院新聞局局長。
特派游錫堃為行政院消費者保護委員會委員並指定為主任委員。
指定中央選舉委員會委員黃石城為主任委員。