中華民國106年9月8日總統令：
行政院副院長林錫耀，行政院政務委員兼福建省政府委員並為主席張景森，行政院政務委員兼行政院公共工程委員會主任委員吳宏謀，行政院政務委員兼國家發展委員會主任委員陳添枝，行政院政務委員兼臺灣省政府委員並為主席、兼蒙藏委員會委員長許璋瑤，行政院政務委員林萬億、吳政忠、鄧振中、唐鳳，行政院秘書長陳美伶，行政院發言人徐國勇，已准辭職，均應予免職。
內政部部長葉俊榮，外交部部長李大維，國防部部長馮世寬，財政部部長許虞哲，教育部部長潘文忠，法務部部長邱太三，交通部部長賀陳旦，勞動部部長林美珠，衛生福利部部長陳時中，文化部部長鄭麗君，科技部部長陳良基，行政院農業委員會主任委員林聰賢，行政院環境保護署署長李應元，行政院大陸委員會主任委員張小月，金融監督管理委員會主任委員李瑞倉，行政院海岸巡防署署長李仲威，僑務委員會委員長吳新興，國軍退除役官兵輔導委員會主任委員李翔宙，原住民族委員會主任委員夷將•拔路兒（Icyang‧Parod），客家委員會主任委員李永得，行政院主計總處主計長朱澤民，行政院人事行政總處人事長施能傑，國立故宮博物院院長林正儀，行政院原子能委員會主任委員謝曉星，北美事務協調委員會主任委員陶儀芬，已准辭職，均應予免職。
行政院副秘書長何佩珊，內政部政務次長花敬群，外交部政務次長吳志中、章文樑，國防部副部長海軍二級上將蒲澤春、陸軍二級上將張冠群，財政部政務次長蘇建榮、莊翠雲，教育部政務次長姚立德、蔡清華，法務部政務次長陳明堂、蔡碧仲，經濟部政務次長沈榮津，交通部政務次長王國材、范植谷，勞動部政務次長廖蕙芳、郭國文，衛生福利部政務次長何啟功、呂寶靜，文化部政務次長楊子葆、丁曉菁，科技部政務次長蘇芳慶、許有進，行政院農業委員會副主任委員陳吉仲、翁章梁，行政院環境保護署副署長詹順貴，國家發展委員會副主任委員龔明鑫、曾旭正，行政院大陸委員會副主任委員林正義、張天欽、邱垂正，金融監督管理委員會副主任委員鄭貞茂，行政院海岸巡防署副署長胡意剛，僑務委員會副委員長田秋堇，國軍退除役官兵輔導委員會副主任委員李文忠、劉樹林，原住民族委員會副主任委員汪明輝、伊萬•納威（Iwan Nawi），客家委員會副主任委員楊長鎮，行政院公共工程委員會副主任委員顏久榮、高福堯，行政院主計總處副主計長陳瑞敏，行政院人事行政總處副人事長蘇俊榮，國立故宮博物院副院長李靜慧，行政院原子能委員會副主任委員蔡慧敏，衛生福利部中央健康保險署署長李伯璋，已准辭職，均應予免職。
特任施俊吉為行政院副院長，張景森為行政院政務委員兼福建省政府委員並為主席，吳宏謀為行政院政務委員兼行政院公共工程委員會主任委員，許璋瑤為行政院政務委員兼臺灣省政府委員並為主席，陳美伶為行政院政務委員兼國家發展委員會主任委員，林萬億、吳政忠、鄧振中、唐鳳為行政院政務委員，卓榮泰為行政院秘書長，徐國勇為行政院發言人。
特任葉俊榮為內政部部長，李大維為外交部部長，馮世寬為國防部部長，許虞哲為財政部部長，潘文忠為教育部部長，邱太三為法務部部長，沈榮津為經濟部部長，賀陳旦為交通部部長，林美珠為勞動部部長，陳時中為衛生福利部部長，鄭麗君為文化部部長，陳良基為科技部部長，林聰賢為行政院農業委員會主任委員，李應元為行政院環境保護署署長，張小月為行政院大陸委員會主任委員，顧立雄為金融監督管理委員會主任委員，李仲威為行政院海岸巡防署署長，吳新興為僑務委員會委員長，李翔宙為國軍退除役官兵輔導委員會主任委員，夷將•拔路兒（Icyang‧Parod）為原住民族委員會主任委員，李永得為客家委員會主任委員，朱澤民為行政院主計總處主計長，施能傑為行政院人事行政總處人事長，林正儀為國立故宮博物院院長，謝曉星為行政院原子能委員會主任委員。
特任海軍二級上將蒲澤春、陸軍二級上將張冠群為國防部副部長，林正義為行政院大陸委員會副主任委員。
任命何佩珊為行政院副秘書長，花敬群為內政部政務次長，吳志中、章文樑為外交部政務次長，蘇建榮、莊翠雲為財政部政務次長，姚立德、蔡清華為教育部政務次長，陳明堂、蔡碧仲為法務部政務次長，龔明鑫為經濟部政務次長，王國材、范植谷為交通部政務次長，廖蕙芳為勞動部政務次長，何啟功、呂寶靜為衛生福利部政務次長，楊子葆、丁曉菁為文化部政務次長，蘇芳慶、許有進為科技部政務次長，陳吉仲、翁章梁為行政院農業委員會副主任委員，詹順貴為行政院環境保護署副署長，邱俊榮、曾旭正為國家發展委員會副主任委員，張天欽、邱垂正為行政院大陸委員會副主任委員，鄭貞茂為金融監督管理委員會副主任委員，胡意剛為行政院海岸巡防署副署長，田秋堇為僑務委員會副委員長，李文忠為國軍退除役官兵輔導委員會副主任委員，汪明輝、伊萬•納威（Iwan Nawi）為原住民族委員會副主任委員，楊長鎮為客家委員會副主任委員，顏久榮、高福堯為行政院公共工程委員會副主任委員，陳瑞敏為行政院主計總處副主計長，蘇俊榮為行政院人事行政總處副人事長，李靜慧為國立故宮博物院副院長，蔡慧敏為行政院原子能委員會副主任委員，李伯璋為衛生福利部中央健康保險署署長。