中華民國99年2月22日總統令：
國家安全會議秘書長蘇起已准辭職，應予免職。
特任胡為真為國家安全會議秘書長。
中華民國99年2月1日總統令：
任命周景揚為行政院國家科學委員會副主任委員。
此令自中華民國99年2月1日生效。
中華民國99年1月22日總統令：
特任吳秀明為行政院公平交易委員會委員並為主任委員。
任命施惠芬為行政院公平交易委員會委員並為副主任委員。
任命林益裕、徐火明、孫立群、林宜男、汪渡村、蔣黎明、蔡蕙安為行政院公平交易委員會委員。
任期均自中華民國99年2月1日起至102年1月31日止。
中華民國99年1月20日總統令：
任命邱華君、呂海嶠、劉昊洲為公務人員保障暨培訓委員會專任委員。
任期自中華民國99年1月30日生效。
任命陳愛娥為公務人員保障暨培訓委員會專任委員。
任期自中華民國99年2月1日生效。
任命楊仁煌為公務人員保障暨培訓委員會專任委員。
任期自中華民國99年2月2日生效。
最高法院檢察署檢察總長陳聰明已准辭職，應予免職。
中華民國99年1月15日總統令：
特派歐育誠為99年第一次暨第二次專門職業及技術人員高等暨普通考試航海人員考試典試委員長。
中華民國99年1月8日總統令：
行政院國家科學委員會副主任委員陳力俊已准辭職，應予免職。
此令自中華民國99年1月31日生效。
中華民國99年1月4日總統聘書：
敦聘國際青年商會中華民國總會總會長塗義澤為中華民國建國一百年慶祝活動籌備委員會委員。
此聘自中華民國99年1月2日生效。
中華民國98年12月30日總統令：
特派詹中原為99年公務人員特種考試身心障礙人員考試典試委員長。
任命鄭守夏為行政院衛生署中央健康保險局局長。
此令自中華民國99年1月1日生效。
中華民國98年12月9日總統令：
行政院文化建設委員會副主任委員張譽騰已准辭職，應予免職。
任命李仁芳為行政院文化建設委員會副主任委員。
此令均自中華民國98年12月10日生效。
特派黃俊英為99年公務人員特種考試海岸巡防人員考試、99年公務人員特種考試基層警察人員考試、99年公務人員特種考試關務人員考試、99年公務人員特種考試經濟部專利商標審查人員考試、99年第一次公務人員特種考試司法人員考試及99年國軍上校以上軍官轉任公務人員考試典試委員長。
中華民國98年11月27日總統令：
特派高明見為99年專門職業及技術人員普通考試導遊人員、領隊人員考試典試委員長。
行政院公民投票審議委員會委員賴浩敏已准辭職，應予免職。
此令自中華民國98年11月4日生效。
中華民國98年11月24日總統令：
任命鄧振中為國家安全會議副秘書長。
此令自中華民國98年11月25日起生效。