中華民國109年元旦總統府升旗典禮由台灣扶輪人元旦升旗典禮委員會主辦，於1月1日（星期三）上午5時起在總統府府前廣場及凱達格蘭大道舉行，總統及副總統伉儷一行於上午6時23分蒞臨會場，並於典禮後向民眾揮手致意返府；活動至上午7時10分結束。