馬英九總統今天上午前往屏東縣林邊鄉、佳冬鄉，視察國軍及環保署執行災後復原工作以及林邊溪疏濬情形，除指示國軍繼續投入人力，幫助居民重建家園外，也耐心聽取災民訴求，要求相關單位協助配合，加速重建腳步。
隨後，總統出席在高雄市綜合體育館舉辦的「八八水災全國追悼大會」並致詞，代表政府及全國人民，對在這次水災中罹難的同胞表達追思與不捨。面對台灣遭遇百年罕見的天災，總統除了感謝國人慷慨無私的捐輸，及國際社會不分國界的愛心義助，也鼓勵國人將承受的苦難化為重生的力量，祈願未來光照台灣，賜福永遠。
全國追悼大會於上午10時30分開始，總統與全體與會者首先起立為罹難者默哀88秒，象徵對往生者的不捨與感念。隨後，包括總統、副總統、五院院長、受災縣市地方首長及民間團體、宗教界代表等，分別上台獻花，表達哀悼與追思之意。
總統致詞內容全文為：
今天，英九以萬分沉痛的心情，率領蕭副總統、五院院長、各部會首長與各縣市長，代表全國同胞共同追悼「八八水災」中所有無辜罹難的同胞。面對同胞罹難，就像失去我摯愛的親人一樣，英九此刻的心情，既哀傷又自責。
過去大家蓽路藍縷、辛勤耕耘，開闢了美麗的家園。奈何百年罕見的超大豪雨所帶來的洪水與土石流，瞬間奪走了數百人寶貴的生命，這是我們心中永遠的傷痛。我知道，再多的補償與安慰，也無法撫平這種刻骨銘心的傷痛。
在這次「八八水災」中，國軍官兵、警消兄弟與全國寺廟教堂、志工團體都發揮「人溺己溺」的人道精神，參與各項救援、安置與重建工作，搶救、安置了數萬災民。但令人不捨的是，八月八日，臺東縣警察局的兩位員警許金次、江文祥在暴雨中外出救人，不幸被洪水沖走失踪；八月九日，雲林縣口湖鄉青蚶村村長繆榮堂，為了及時開啟排水閘門，執行防汛任務，在強風驟雨當中，不幸落水殉職；八月十一日，內政部空勤總隊直昇機飛行員張順發、王宗立及機工長黃鎂智，在惡劣的天候下毅然出勤救護任務，竟因失事而慷慨殉職；八月十四日，南投縣義消張瑞賢參與搜尋濁水溪失蹤災民時，也不幸在湍急的濁流中殉職。
各位鄉親，我們今天含著眼淚，感謝這七位勇士；感謝他們犧牲自己，保護百姓；感謝他們默默展現人性中最可貴的勇敢、奉獻與無私的精神！各位勇士：您們忠肝義膽的情操與事蹟，英九以及全國同胞都將在心中牢記一生。我們已將殉職者的英靈入祀忠烈祠，讓各位的精神光照臺灣、永垂不朽。
這次「八八水災」造成的一切災害，政府一定會深入檢討、痛加改進、並承擔責任。為了加速災後重建腳步，政府制定了「莫拉克颱風災後重建特別條例」，編列1,200億元的特別預算，行政院也成立重建推動委員會，由劉兆玄院長親自坐鎮高雄指揮重建工作。原先在學校、寺廟、教堂等臨時收容所的災民，目前九成二以上已經安置在國軍與退輔會等機關的營舍中或接受補助自行租屋，生活大致安定下來。各種慰助金的發放已達八、九成；沖毀的道路或橋樑，目前八成五已經搶通；淘空的堤防，全部搶險完成；淤積的河道，也開始疏通。慈濟、紅十字會、世界展望會等慈善團體與企業界並響應政府號召，將為災民興建逾千座的永久屋，災後重建工作已經穩健上路。
英九深切瞭解到災後重建的路還很長，無論如何政府一定要盡最大努力，協助災民解決生活、就業、就學、就醫、就養、補償、輔導等種種問題，請鄉親們放心。英九願意傾聽每一位鄉親的需求和意見，以彌補政府的缺失與不足，政府一定會和大家站在一起，共同攜手重建家園。
對於過去政府該做而沒做好的水土保持、防洪工程及橋樑建設，政府會全面檢討，並嚴格督促改善。我們要儘速完成「國土計畫法」的立法工作，全面加強山林水土保持，建立一個不與山爭地、不與河爭地，與自然共生的國土規劃體系，希望提供鄉親同胞們安全的土地，重新過正常的生活。
最後，英九要再一次感謝參與這次「八八水災」救災與重建行列的政府、民間部門，包括國軍官兵、警消人員，以及來自全國各地的宗教團體與志工朋友們，更要感謝國人同胞和海內外人士慷慨解囊。謝謝您們！
英九還要藉此機會，感謝來自全球85個國家與中國大陸對「八八水災」災民提供的捐助、救援與關懷。其中，美國即時提供直昇機，直接投入救災工作。日本、新加坡、韓國和包括甘比亞在內的各友邦捐款賑災，共達新台幣3億8,500萬元。此外，大陸當局和大陸同胞踴躍捐輸，除了提供1,000戶的組合屋和其他救災物資之外，大陸地區捐款至今已超過新台幣50億元，這是所有外來捐款中最大的一筆，展現兩岸人民「血濃於水」的民族感情，英九願在此表達由衷的謝忱，也希望兩岸未來在災難救助與重建方面，能相互學習經驗與合作，共同抵禦自然災害。
「八八水災」給台灣帶來可怕的災難與創傷，但也帶來全球溫馨的關懷與善意，充分體現了地球村「守望相助」、「民胞物與」的博愛精神，我們深深的感動，也深深的感謝。
最後，英九要代表政府與全國同胞，在此告慰不幸罹難的英靈：請安息吧。政府會在最短的時間內，協助災民從廢墟中站起來，今天，英九以中華民國總統的身分，以最謙卑虔誠的心，向罹難英靈獻上鮮花，祈求您們繼續呵護庇佑這塊土地，讓每一位受災鄉親都堅強的站起來，化悲傷為力量，以信心重建美麗家園，展現出我們臺灣人民最強韌的生命力！