馬英九總統今天下午在總統府召開中文記者會，對莫拉克颱風在南台灣造成嚴重災情以及政府在救災過程中未能符合民眾期待，特別起立鞠躬，向國人表達最誠摯的歉意，也說明政府已成立重建委員會，將全力進行災民安置與災區重建工作。
總統致詞內容為：
這次莫拉克颱風侵襲台灣，帶來超大豪雨，造成南台灣重大災害，有數百位民眾往生或失蹤，道路、房屋、橋樑受到嚴重的沖毀或淹沒，農田、魚塭也受到重創，損失超過數百億、近千億，在災害發生之後，政府雖然在第一時間就投入救災，但搶救災害的作為仍遭到民眾與媒體的質疑，認為政府的作為不夠積極、不夠努力，我身為國家的領導人，對於政府整個救災過程當中的疏失，都需要概括承受這個責任，只要是政府做不好的地方，都是我的責任，我要在這裡對全國的人民，尤其是對於在這次災害當中喪失親人的民眾，表達我最誠摯的歉意。
在過去的10天當中，我們全力投入救災工作，一共救出39,000多位民眾，其中用直昇機救出8,800多人，如果不是因為天候的限制，我們應該可以做得更快、更好。隨著救災工作告一段落，我們應該開始檢討，在救災過程當中有哪些地方不符合民眾的期待。
首先要檢討的是，為什麼民眾感覺到我們的救災過程慢而且亂，這個我們必須要給全國人民一個交代，所以行政團隊應該要進行徹底的調查，如果在調查的過程當中，發現政府官員有疏失，就應該負起他的行政責任，甚至政治責任，這點，我和劉院長已有共識，會在救災與安置工作告一段落之後向外界說明，時間不會晚過9月初。
然而現在，救難人員還在進行救災或重建，如果此刻即進行究責，一定會影響救災人員的士氣，妨礙救災與安置的工作。其實這些救災人員，包括國軍以及來自各方的救難人員，已經沒日沒夜的工作10天，有6位曾經為了救人而犧牲他們寶貴的生命，救災人員真的、真的非常辛苦，我們要對他們多加鼓勵肯定，讓他們好好地完成任務。
這次民間救災力量讓人非常感動，在最短時間內全國民眾自動自發將資源與人力送到災區，這塊土地上的人民以行動展現最大的愛心。我們看到許多人即使並不認識、未曾來往，但當災難發生的時候，都能夠不分彼此踴躍捐輸，一起投入救災的行列，這個心情是台灣最哀痛的時刻，但也凸顯台灣社會的凝聚力與團結力，我們都是一家人，我們都是命運共同體。
此外，我也要代表政府與全國民眾感謝國際社會與大陸的援助，讓我們深刻感受到台灣並不孤獨，在地球村我們仍然有許多關心我們的朋友支持我們。
第三，我們如何面對未來的災害，除了究責之外，一定要面對問題、承認問題、改進問題、解決問題，所以我希望立刻著手成立「災害防救署」來取代現在的「消防署」，讓它成為在內政部之下專責的災害防救機構，各縣市也分別設立「災害防救局」，我們要給它足夠的人力與設備，還有配套措施，讓它能夠有效運作，同時對整個防災體系也要進行檢討，加強溝通聯繫功能。
第四，今後國軍要把災害防救作為中心任務。要作到這一點，未來的國軍在戰略、戰術、兵力結構、經費預算及機具裝備等方面都應該納入防災救災的考慮，我們現在正在向美方採購60架黑鷹直昇機，我們已經決定把60架減為45架，減下來的15架，價值大約3億美金，等於100億台幣，我們會運用這筆錢來採購救難直昇機與相關裝備，儘快讓空勤大隊的飛機能夠改善。
第五，在防災方面投入更多努力，我們要有效制訂撤離居民的標準作業程序，在平常要時常教育、訓練、演習，這樣才能在災害發生時減少危險。
第六，今年國慶慶典我們決定不再舉辦，同時本來10月下旬我個人要到南太平洋友邦參加區域高峰會的行程也全部取消。
第七，我們現在已經從救災的階段進入到安置與重建階段，在過程中所需要的預算與人力比救災時期更為龐大，因此我在本月14日召開國安會議，行政院也成立了重建委員會，正全力推動當中。有關安置時租屋、購屋、修繕及其他補助問題，等一下各位如果有需要，我會請在場首長提供資料。
總而言之，今天召開記者會就是要向大家表明，我們對救災過程中的疏失表示歉意，願意拿出最大的誠意與決心把往後的工作做好，把台灣帶出困境。謝謝大家。