陳總統水扁先生今天下午偕同呂副總統秀蓮女士出席回復名譽證書頒發典禮，代表政府及人民再次向所有白色恐怖受難者及其家屬，表達最高的歉意。並代表政府頒發回復名譽證書，及應邀致詞。
總統致詞內容為：
今天，阿扁在此代表政府頒發回復名譽證書給白色恐怖的受難者，我們再度以最誠敬的心與面對歷史的勇氣，為台灣的民主進程和人權發展，寫下新的一頁。
臺灣於二次戰後歷經長達三十八年的戒嚴，期間因所謂的「叛亂」或「匪諜」案件而造成的冤、錯、假案受裁判者，不僅生命或自由遭受剝奪，名譽更是嚴重受損，而對於受裁判者及其家屬而言，更是一生永難忘懷的傷痛。為了還給歷史清白和應有的公道，立法院通過了「戒嚴時期不當叛亂暨匪諜審判案件補償條例」，依該條例成立了「戒嚴時期不當叛亂暨匪諜審判案件補償基金會」，就申請的個案事實謹慎審認，期望能給受裁判者或其家屬最公正、最合理的補償，也彰顯顯政府追求社會公義、撫平歷史傷痛、積極化解仇恨、促進族群融合的努力。
人權是世界和平的基礎，也是民主憲政的根基。雖然過去的獨裁者在台灣實施了世界上最長的戒嚴法，仍有許多前輩在民主憲政改革、爭取人權的路上，前仆後繼，絕不放棄，因而被威脅、囚禁，甚至失去寶貴的生命，如此的情操與志節，實在是我們的典範，在我們追求進一步的民主鞏固與深化的時候，更發人省思。
在過去的戒嚴時代，阿扁曾經擔任美麗島事件的辯護律師，與呂副總統及在座的許多民主前輩、人權鬥士一樣，親身體會到爭取民主自由及人權保障所必須面對的種種困難與挑戰，我們要珍惜得來不易的民主自由的果實，而政府也一定會繼續努力落實人權立國的政策，除了表達我們對過去所有人權鬥士的尊敬與懷念之外，也為我們的後代子孫建立一個自由、公正、安全、有尊嚴的生活環境。
蔡政委自民國八十九年六月接任基金會董事長後，即致力於撫平戒嚴時期政治案件受害者及其家屬的傷痛，並加速補償金的發放事宜，基金會迄今共受理申請案近七二九二件，處理完畢的案件已達六七一六件，績效卓著，充分展現政府辦理補償的誠意與決心，在此阿扁要特別感謝全體董監事及會務人員的辛勞付出。
最後，阿扁要代表政府與人民，再次向所有白色恐怖受難者及其家屬，表達最高的歉意；也期勉大家和政府一起攜手合作，未來無論在加強人權的維護、人民各種權利與自由的保障、民主的深化方面，共同為我國的人權福祉來努力。